人类考古记录中充满了犬类的粪便

在一个有7000年历史的考古中国农庄发现的犬类粪便。图片来源：JADA KO
（神秘的记录地球uux.cn报道）据中国科学报（徐锐）：如今已是美国史密森学会下属国家自然历史博物馆考古学家的Melinda Zeder，始终忘不了早年的中充一次考察经历。
据《科学》报道，满犬1981年，粪便当时还是人类研究生的Zeder正在整理伊朗西南部一个旧石器时代洞穴中的动物骨骼，突然她发现了一块无法辨认的考古碎片。
“当你难以区分石头和骨头时，记录就把舌头放在上面来辨别。中充”Zeder说，满犬如果碎片是粪便骨头，它会粘住舌头。人类Zeder确实那样做了，考古但碎片并不粘舌，记录却开始溶解。她非常不解，向更有经验的同事求助。那名同事笑了：“那是鬣狗的粪便。”
这种饱经沧桑的古老粪便可以历经数千年不毁，甚至能够保留其原始的形状和颜色。考古学家通常可以根据大小和其他属性区分人类和动物的粪便。但事实证明，狗的粪便很难与人类的排泄物区别开来，这可能会阻碍研究人员重建古人的饮食习惯。
哈佛大学分子考古学家Christina Warinner和同事开发出一种基于人工智能的工具，他们声称这种工具能够准确区分人类和狗的“古粪便”。在分析了数千年来的十几个样本后，他们得出了一个令人惊讶的结论：考古记录中充满了犬类的粪便。
Warinner向世界各地的考古学家索取古代人类粪便样本的初衷，是为了研究栖息在人类肠道中占比最大的微生物群——细菌是如何随着时间的推移而改变的。它们会在人类的粪便中留下痕迹。
然而，Warinner收到的样本使她十分困惑：“我们原以为收到的一定都是人类粪便，但得到的数据却很奇怪。”
由于有些人吃狗肉，所以人类的古粪便中可能含有犬类遗传物质；犬类的粪便中也可能含有人类DNA，因为犬类有时会吃人类的粪便。但是，当Warinner研究小组对样本（其中一些是粪化石）中的遗传物质进行分析时，发现一些样本含有大量的犬类DNA，它们只可能来自犬类。
为了找到更好的方法区分两者，Warinner求助于她的研究生、正在德国马普学会人类历史科学研究所攻读生物信息学博士学位的Maxime Borry。
Borry从粪便样本中收集了所有的DNA，其中不仅包括人类和犬类的遗传物质，还包括来自微生物、植物和主人肠道中的其他任何东西的基因序列。然后，他构建了一个机器学习程序，学习如何在现代人和犬类粪便样本的大量数据之间建立关联。
研究人员将得到的名为coproID的程序应用到13个样本中（样本范围从一个有7000年历史的中国农庄回收的粪便，到从英格兰南部一个有400年历史的家族采集的粪便）。他们还对7个对照样品（不含粪便但来自可能发现粪便的沉积物，包括古代垃圾堆和人类骨骼的盆腔等）进行了测试。
coproID将所有的对照样品归类为非粪便。Warinner研究小组近日在PeerJ报道称，他们还确认了7个样本的归属，其中5个是人类粪便，两个是犬科动物粪便。
最令人惊讶的发现是来自17世纪英国家庭的粪便样本。在20世纪80年代的一次翻修中，工人在屋顶附近发现了一个装有沉积物的壶。他们把它送到当地一个博物馆，并作为展品在那里放了几十年，标签显示“三个人的粪便”，但coproID报告说这些粪便并非来自人类，而属于一条狗。
Zeder希望这种新方法能够为人类和犬类关系的演变提供新的视角。15000多年前，人类驯养了狗，但具体是何时、何地、如何发生的，至今仍是个谜。
相关论文信息：https://doi.org/10.7717/peerj.9001
相关报道：科学家研发出能分辨人粪和狗粪的AI
（神秘的地球uux.cn报道）据俄罗斯卫星网：《新科学家》(New Scientist)杂志刊文称，科学家研发出新的人工智能技术，能分辨出考古发掘现场的粪便。
德国德国马克斯·普朗克研究所研究员发明了AI的这一特殊用法。
古代粪便或粪石富含人类先祖生活的信息，但考古现场找到的粪便既有可能是人的粪便，也有可能是狗的粪便，所以有必要采用人工智能技术。
人粪和狗粪甚至用DNA技术都难以分辨，狗粪中也能发现人类DNA的痕迹，因为狗常常嗅闻其他动物的粪便，包括人粪。
人粪中也有可能发现狗的DNA，因为古代很长一段时间里，吃狗都被认为是正常行为。
程序CorpoID能分析粪便中所有DNA。掌握足够样本资料后，该程序被用于分析古代粪便。为了增加AI的工作难度，科学家在识别样本中添加了土壤作为干扰项。
CorpoID优异地完成了任务，面对土壤样本，它成功识别其为“来源不明”，而在另外7次识别任务中准确辨别出了粪便所属。

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